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      • Utiliser des outils de visualisation des données sur les ensembles de données SEND : un graphique vaut mille points de données


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        Publié le 20 mai 2019, 4:11 PM

        SEND ["Standard for Exchange of Nonclinical Data" soit le standard d'échange pour les données précliniques] est plus qu'un simple outil qui facilite la présentation des données précliniques à la FDA. Les ensembles de données SEND sont riches en informations, mais sous une forme dont l'exploration est chronophage pour les personnes non expertes. Avec les bons outils de visualisation, les ensembles de données SEND peuvent influencer la forme des programmes précliniques et apporter des informations importantes.

        Comment les outils de visualisation des données vont-ils m'aider à utiliser SEND ?

        Une terminologie contrôlée est pratique pour la présentation des données, car elle donne aux investigateurs la possibilité de se plonger dans les moindres détails de l'étude. Utiliser un outil de visualisation réduit considérablement le temps nécessaire pour passer au crible les résultats de pathologies anatomiques. Comme ces données sont de nature qualitative, la possibilité de les quantifier, d'utiliser un code couleur, de les grouper et de les trier facilite l'examen des données à la recherche de structures qui se répètent et de tendances et pour identifier les valeurs aberrantes.

        Voici quelques exemples de la façon dont la visualisation peut rendre la lecture des données plus simple et plus rapide :

        Exemple 1 : visualisation des effets secondaires rapportés dans un ensemble de données SEND

        La figure 1 ci-dessous montre des observations potentiellement inquiétantes d'une étude : cinq sujets de sexe masculin souffrant de « Néphropathie, progressive chronique - Sévère » ; les détails ont été développés dans un tableau pour les sujets concernés.

        Figure 1. Visualisation des effets secondaires observés reportés dans l'ensemble de données SEND.

        Exemple 2 : rapport sur les effets secondaires dans un modèle de recherche unique

        La figure 2 montre un sujet singulier de l'étude que les investigateurs ont sélectionné pour étudier d'autres tissus ou conclusions plus en profondeur. Cette caractéristique permet aux investigateurs de dresser le profil des résultats d'un seul sujet afin d'identifier des tendances concernant les effets secondaires.

        Figure 2. Rapport sur les effets secondaires observés dans un modèle de recherche unique.

        Exemple 3 : résumé des paramètres cliniques de l'ensemble de données SEND

        Avant la visualisation

        Sans aucune assistance de visualisation des données, l'étude SEND ci-dessous (tableau 1) montre un paramètre clinique (PC) par page et un sexe par page. Mais cette page n'est pas la seule page de données concernant les hommes pour ce paramètre. En fait, le rapport complet des résultats concernant les hommes et les femmes pour trois paramètres prend 11 pages.

        Tableau 1. Résumé des paramètres cliniques de l'ensemble de données de SEND.

        Les résultats individuels pour ces trois mêmes paramètres occupent 24 pages.Toutes les données des PC de cette étude sont rapportées sur plus de 500 pages dans le rapport de contributeur PC. Le rapport complet de l'étude faisait plus de 1500 pages. En raison de cette longueur, il faut beaucoup de temps pour suivre les résultats d'un sujet et l'interprétation en devient peu intuitive.

        Après visualisation

        Pour faciliter la compréhension de ces données, elles ont été réunies dans une visualisation. Dans la Figure 3, les trois mêmes paramètres de l'ensemble de données ci-dessus sont résumés sur un seul écran, organisés en deux catégories, sexes confondus (en haut) et séparés (en bas).

        Étant donné que l'outil de visualisation est interactif, les scientifiques peuvent facilement passer du résumé aux données individuelles, aux modèles de recherche individuels, à différents paramètres, etc. Vous pouvez également sélectionner un seul sujet pour faire ressortir ses données dans toutes les visualisations associées.

        Figure 3. Visualisation de l'ensemble de données SEND.

        Exemple 4 : observations cliniques d'un ensemble de données SEND

        Avant la visualisation

        Dans un autre ensemble de données, le tableau 2 indique le nombre de sujets avec une observation à n'importe quel moment de l'étude. Cependant, il n'indique pas combien de fois la même observation a été faite.

        Le tableau de résumé a été divisé par lot, ce qui signifie que les observations de chaque catégorie sont séparées par plus de 10 pages. Le tableau de résumé fait 20 pages avec des tableaux individuels sur 424 pages, tandis que le rapport complet de l'étude compte plus de 2700 pages.

        Tableau 2. Résumé des observations cliniques de l'ensemble de données de SEND.

        Après visualisation

        Avec les outils de visualisation des données, toutes les peaux et tous les pelages sont représentés dans un seul et même tableau (figure 4). Les bandes indiquent combien de fois l'observation a été faite pour chaque sujet. Toutes les observations sont désormais visibles sur un même écran, et l'utilisateur peut filtrer les résultats en sélectionnant d'autres groupes, paramètres ou sujets particuliers.

         

        Figure 4. Visualisation de données de l'ensemble de données SEND.

        Quels outils de visualisation des données puis-je utiliser ?

        Chez Covance, nous utilisons les outils de visualisation des données en interne pour mieux lire et comprendre nos ensembles de données. Et vous pouvez faire la même chose avec vos propres ensembles de données.

        De nombreux outils de visualisation sont disponibles sur le marché. Ils acceptent des données brutes et transforment de longs rapports d'études en graphiques intuitifs et interactifs. Étudiez la question et recherchez un outil qui s'intègre bien avec vos systèmes de données existants.

        Si vous avez plus de questions concernant SEND ou la visualisation des données, n'hésitez pas à nous contacter. Pour en savoir plus sur SEND, consultez notre Centre d'information sur la norme SEND.

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